Możesz pomóc w znalezieniu leku przeciwko koronawirusowi SARS-CoV-2. Wystarczy komputer
W ramach projektu Folding@Home możemy teraz pomóc w walce z koronawirusem. Każdy chętny może poświęcić część mocy obliczeniowej swojego komputera na rzecz pracy nad poszukiwaniem szczepionek i leków zwalczających SARS-CoV-2. Wystarczy odpowiednie oprogramowanie, które znajdziemy tutaj.
Folding@Home to jeden z wielu projektów rozproszonego przetwarzania danych. Uczestniczą w nich miliony internautów z całego świata. Wystarczy wejść na stronę takie projektu i zainstalować niewielki program. Dzięki niemu nasz komputer będzie ze strony projektu pobierał dane, przetwarzał je, i odsyłał do projektu wyniki swoich obliczeń. Dzięki olbrzymiej liczbie podłączonych komputerów takie projekty dysponują olbrzymią mocą obliczeniową, co znacznie przyspiesza badania naukowe.
Projekt Folding@Home skupia się na badaniach z dziedziny medycyny, związanych ze zwijaniem białek, projektowaniem leków i innych zagadnieniach z zakresu dynamiki molekuł. Takie badania wymagają gigantycznych mocy obliczeniowych.
Dotychczas w ramach projektu Folding@Home można było wspomagać badania nad nowotworami piersi, nowotworami nerek, białkiem p53, epigenetyką nowotworów, chorobą Chagas oraz chorobami Alzheimera, Parkinsona i Huntingtona. Teraz dołączono doń badania związane z poszukiwaniem w wirusie SARS-CoV-2 protein, które można będzie zaatakować za pomocą leków. W ten sposób każdy z nas może przyczynić się do wynalezienia leku na COVID-19. Folding@Home będzie wykorzystywał tylko wolne zasoby naszego procesora centralnego (CPU) i graficznego (GPU). Możemy więc bez problemu używać komputera, w czasie gdy Folding@Home będzie w tle przeprowadzał swoje obliczenia.
Po zainstalowaniu oprogramowania zobaczymy prosty panel kontrolny. Najważniesza dla nas jest lista rozwijalna o nazwie "I support research fighting". Jeśli chcemy pracować nad lekiem na koronawirusa powinniśmy wybrać „Any disease”. Wówczas nasz komputer będzie prowadził obliczenia na rzecz leku nad COVID-19. Choroba ta ma bowiem priorytet i ci, którzy nie wybiorą z listy rozwijalnej innej choroby zostaną zaprzęgnięci do walki z SARS-CoV-2.
Komentarze (46)
ex nihilo, 14 marca 2020, 15:30
Niby się instaluje, ale się nie instaluje (Mint). Łyka pakiety i to wszystko, nie odpala okienka administratora.
Felipesku, 14 marca 2020, 16:15
A superkomputery to co w tej chwili robia? Jakie zadania im na najblizszetygodnie przydzielono i jakie mialy w poprzednich tygodniach tak wazne zadania, ze potrzeba mocy obliczeniowej uzytkownikow domowych? ... XXI wiek a nawet nie obmyslono jeszcze sposobu na unieszkodliwienie bakterii powodujacych pruchnice zebow... od ilu wiekow??? Ale znajda na szybko sposob na unieszkodliwienie wirusa !.... To jest żart chyba jakis co sie na tym swiecie dzieje. Proponuje zwiekszyc moc anten gsm.
Daniel O'Really, 14 marca 2020, 18:37
Obmyślono. Ta tajna metoda, o której nie wiesz, nazywa się "higiena jamy ustnej". Zachęcam do przetestowania, działa :)
ex nihilo, 14 marca 2020, 19:31
To nie chce być takie proste. Jak ktoś jest podatny, ma przechlapane. Znam osoby, które bardzo o zęby dbają, i codziennie, i u dentystów zostawiły już niezły samochód, a i tak coraz mniej prawdziwych w paszczy mają. Przez próchnicę.
Daniel O'Really, 14 marca 2020, 19:36
A zainstalowałeś FAHControl? U mnie wszystko hula (Ubuntu 18.04). Zainstalowałem wszystkie 3 apki (client, control i viewer)
ex nihilo, 14 marca 2020, 20:48
Też 18.04. Próbowałem wszystkie trzy. Jutro spróbuję z konsoli, ale w tych sprawach wołowa d*pa jestem
Poza tym 18.04/Mint mam dopiero od dwóch tygodni. W ogóle pingwina od 16 lat, kompy >30, ale grzebać w tym cholernie nie lubię, bo jak mnie wciągnie, to... a za dużo już tego wszystkiego.
dexx, 14 marca 2020, 22:04
Od lat mam na kompie odpalonego Boinca i udostępniam zasoby dla między innymi rosetta@home. Nie zamierzam zmieniać na folding@home, bo po pierwsze mają swoją dedykowaną aplikację - czyli nie mogę wybrać do czego ile zasobów przydzielić a po drugie zgadzam się z Felipesku - jeśli miało by to mieć jakikolwiek sens w przypadku Cov-2 to powinny się tym zajmować superkomputery.
Daniel O'Really, 14 marca 2020, 22:36
Też jestem zdania, że nie zaszkodziłoby wykorzystać istniejące superkomputery do rozwiązania tego problemu. Niestety nie mamy możliwości wpłynięcia w jakiś sensowny sposób na właścicieli superkomputerów, żeby uzmysłowili sobie, że "powinni" je wykorzystać w taki czy inny sposób, a mamy możliwość pomóc użyczając mocy obliczeniowej swoich komputerów w projekcie Folding@Home. Mając wybór pomiędzy bezczynnym malkontenctwem a próbą, choćby niewielkiego przechylenia szali na rzecz poprawy stanu rzeczy, wybieram to drugie.
Flaku, 14 marca 2020, 22:55
Też na razie nie zmieniam z boinca, ale z tymi superkomputerami to zachęcam do udzialu każdego, kto akuratma jakiś pod ręką. Jeśli nie, to może przynajmniej udostępnić zwykłą maszynę.
cyjanobakteria, 15 marca 2020, 03:39
Nie karm trolla, bo dostanie próchnicy
Kiedy bolą go zęby, robi się jeszcze bardziej marudny 
ex nihilo, 15 marca 2020, 05:36
Ok, wlazło, ale z zapisanych pakietów (bez konsoli), bezpośrednio nie chciało.
Daniel O'Really, 15 marca 2020, 09:40
@Astro Otwórz FAHControl. Wejdź w Slots, zaznacz cpu, wejdź w Edit i tam będziesz miał "Configure folding slots". W części opisanej jako CPU masz okienko opisane jako "The number of CPU threads this slot should use. -1 (wartość domyślna) lets the client choose." Czyli jeśli jest -1 klient wybiera ile wątków jest zajętych przez FAH. Wpisz tu liczbę wątków, jaką chcesz przeznaczyć na to zadanie. Jeśli masz procesor z Hyper Threating, na każdy rdzeń przypadają 2 wątki, jeśli nie to 1 wątek na rdzeń. Załączony obrazek jest z UI na Linux, więc jeśli masz inny system, może to wyglądać trochę inaczej, ale pewnie nie aż na tyle, żeby nie znaleźć tego ustawienia.
Jajcenty, 15 marca 2020, 10:20
Mam duży kłopot z instalacją. Braki paczek, zależności, etc. Nie mam FAHControl i czasu na zmaganie się z tym, ale mam /etc/fahclient/config.xml - Jak powinien wyglądać jeżeli chcę:
a) liczyć COVID-19
b) oddać wszystkie rdzenie - raptem 6
Może jakaś dobra dusza podzieli się swoim configiem ? bez hasełek oczy wiście
Aktualny stan:
<config>
<!-- Client Control -->
<fold-anon v='true'/>
<!-- Folding Slot Configuration -->
<gpu v='false'/>
<!-- User Information -->
<user v='Jajcenty'/>
<!-- Folding Slots -->
<slot id='0' type='CPU'/>
</config>
h4r, 15 marca 2020, 10:26
Co to za śmieszny artykuł? Przecież Summit już to zrobił.
Jajcenty, 15 marca 2020, 11:08
meny dzienks
Mariusz Błoński, 15 marca 2020, 12:52
No dobra, to ja mam też pytanie.
Na Windzie instalacja bez problemu. Działanie bez problemu. Ale po restarcie komputera nie tylko automatycznie nie odpala, ale z konta użytkownika nie mam do niego dostępu. Muszę przelogować się na admina i odpalić ręcznie, mimo że jest skonfigurowany na automatyczne odpalanie.
Ktoś wie, co z tym zrobić?
ex nihilo, 15 marca 2020, 13:49
Heh... trochę mnie pocieszyło, że nie tylko ja, totalna d. w tych sprawach, miałem problemy
Ale działa. Komp z czasów dinozaurów (core duo 2x3.0), ustawienie "low", reszta fabrycznie. Zabrał sobie jeden rdzeń. Praktycznie nieodczuwalne - normalnie grzebię w sieci, nie grzeje się (ok. 40 +/- 3), innych świństw też nie robi, RAM żre minimalnie, jakieś 0,2G z 8. Później może dostanie "medium".
Czyli spoxik i luzik, niech se mieli, przynajmniej coś sensownego mieli, a nie ciągle te gołe baby
Jajcenty, 15 marca 2020, 17:52
Fatalny zbieg okoliczności. Tak się koledzy z KW napalili na liczenie białek, że im FAH serwis klęknął... najpierw opowiadał że no 'WUs for this configuration' a potem ordynarne HTTP 500 . Ale już jest dobrze. Wcześniej zainstalował mi jakąś przykrą wersję sqlite i nie umiał jej użyć. KOmedia pomyłek jak pod windowsem. Ale po deinstalacji i instalacji TYLKO clienta poszło:
tempik, 15 marca 2020, 18:19
Jesteście pewni że nie kopiecie komuś coinów?
Daniel O'Really, 15 marca 2020, 18:38
Też się nad tym zastanawiałem. Niestety za chudy jestem między uszami, żeby wiedzieć jak to zweryfikować, więc jeśli jest tu ktoś kto byłby w stanie to zrobić, byłoby super. Muszę się przyznać, że uwierzyłem w uczciwość twórców FAH bez wystarczających dowodów tę uczciwość potwierdzających.
ex nihilo, 15 marca 2020, 19:03
Kiedy miałem problemy z instalacją, ryłem trochę po sieci - nie trafiłem na jakieś podejrzenia, a pewnie coś by było gdyby była podstawa.
https://pl.wikipedia.org/wiki/Folding@home
Daniel O'Really, 15 marca 2020, 19:10
Niekoniecznie. Gdybym ja chciał wykorzystać naiwnych idealistów, do kopania dla mnie kryptowalut, przeznaczyłbym jakąś część mocy na prawdziwe, legalne badania a część na kopanie. Moc obliczeniowa byłaby za free, więc nie szkoda byłoby jej trochę przeznaczyć na "dym i lustra". Przypuszczam też, że grupa ludzi potrafiąca zrealizować taki plan technicznie, nie miałaby problemu z wykorzystaniem algorytmu do wyszukiwania i kasowania nieprzychylnych opinii.
ex nihilo, 15 marca 2020, 19:15
Do sprawdzenia powinien wystarczyć mail do SU - mogą porównać parametry sprzętu i ustawienia z czasem obróbki pakietu. Zresztą pdp wszystko to jest przesyłane od razu na ich serwer.
Flaku, 16 marca 2020, 08:57
Ja tam uniwersytetowi Stanforda wierzę. Tym bardziej, że to nie jest świeży projekt. Chłopakom w ciągu lat udało się osiągnąć parę sukcesów.